UniDec
Universal Deconvolution of Mass and Ion Mobility Spectra
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UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel Class Reference

Public Member Functions

def __init__ (self, numtotprot, numtotlig, data, pconc, lconc, nodelist, header, removeoutliers=False, plot1=None, plot2=None, plot3=None, bootnum=1, maxsites=0, kwargs)
 
def FindBestModel (self, fixedprotmodel, fixedligmodel)
 
def RunKDFit (self, kwargs)
 
def Return (self)
 
def SetupModel (self, kwargs)
 
def ModPaths (self)
 
def MakeFitGrid (self)
 
def OutlierTest (self)
 
def Bootstrap (self, std, numpts)
 
def RunBootstrap (self)
 
def GraphPlot
 
def PlotTrace
 
def PlotHist
 

Public Attributes

 outlierflag
 
 plot1
 
 plot2
 
 plot3
 
 protflag
 
 ligflag
 
 mode
 
 header
 
 maxsites
 
 kdargs
 
 randfit
 
 bootnum
 
 numtotprot
 
 numtotlig
 
 nprot
 
 nlig
 
 data
 
 fixedligmodel
 
 fixedprotmodel
 
 findmodelflag
 
 plotflag
 
 ligmodel
 
 fit
 
 degenkds
 
 residuals
 
 stdres
 
 error
 
 reactions
 
 nodes
 
 kdmap
 
 numkd
 
 graph
 
 ugraph
 
 nodenames
 
 fitgrid
 
 stddevs
 
 meanfit
 

Constructor & Destructor Documentation

def UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.__init__ (   self,
  numtotprot,
  numtotlig,
  data,
  pconc,
  lconc,
  nodelist,
  header,
  removeoutliers = False,
  plot1 = None,
  plot2 = None,
  plot3 = None,
  bootnum = 1,
  maxsites = 0,
  kwargs 
)

Member Function Documentation

def UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.Bootstrap (   self,
  std,
  numpts 
)

Here is the call graph for this function:

def UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.FindBestModel (   self,
  fixedprotmodel,
  fixedligmodel 
)

Here is the call graph for this function:

def UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.GraphPlot (   self,
  ax = None 
)

Here is the call graph for this function:

def UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.MakeFitGrid (   self)

Here is the call graph for this function:

def UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.ModPaths (   self)
def UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.OutlierTest (   self)

Here is the caller graph for this function:

def UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.PlotHist (   self,
  topax = None 
)
def UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.PlotTrace (   self,
  topax = None 
)
def UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.Return (   self)
def UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.RunBootstrap (   self)
def UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.RunKDFit (   self,
  kwargs 
)

Here is the call graph for this function:

Here is the caller graph for this function:

def UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.SetupModel (   self,
  kwargs 
)

Here is the caller graph for this function:

Member Data Documentation

UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.bootnum
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.data
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.degenkds
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.error
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.findmodelflag
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.fit
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.fitgrid
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.fixedligmodel
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.fixedprotmodel
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.graph
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.header
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.kdargs
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.kdmap
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.ligflag
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.ligmodel
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.maxsites
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.meanfit
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.mode
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.nlig
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.nodenames
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.nodes
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.nprot
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.numkd
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.numtotlig
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.numtotprot
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.outlierflag
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.plot1
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.plot2
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.plot3
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.plotflag
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.protflag
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.randfit
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.reactions
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.residuals
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.stddevs
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.stdres
UniDec.unidec_modules.UniFit.KDmodel.ugraph

The documentation for this class was generated from the following file: